Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
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