Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms