Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.55■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG3Q9UJ98 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG3Q9UJ98 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG3Q9UJ98 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG3Q9UJ98 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG3Q9UJ98 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG3Q9UJ98 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG3Q9UJ98 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG3Q9UJ98 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG3Q9UJ98 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG3Q9UJ98 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG3Q9UJ98 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms