Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms