Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BSDC1Q9NW68 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSDC1Q9NW68 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms