Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms