Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms