Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPRTNQ9H040 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms