Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms