Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM5DQ9BY66 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms