Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms