Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM20AQ96MK3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
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