Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMNQ96JQ2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLMNQ96JQ2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLMNQ96JQ2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CLMNQ96JQ2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLMNQ96JQ2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLMNQ96JQ2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLMNQ96JQ2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLMNQ96JQ2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLMNQ96JQ2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms