Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARMIL3Q8ND23 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms