Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP188Q5SRE5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms