Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC93Q567U6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms