Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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