Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms