Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP153P49790 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP153P49790 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP153P49790 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP153P49790 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP153P49790 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP153P49790 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP153P49790 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP153P49790 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP153P49790 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP153P49790 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP153P49790 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP153P49790 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP153P49790 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP153P49790 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP153P49790 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP153P49790 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP153P49790 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP153P49790 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP153P49790 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP153P49790 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP153P49790 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP153P49790 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP153P49790 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP153P49790 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP153P49790 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP153P49790 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP153P49790 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP153P49790 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP153P49790 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP153P49790 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP153P49790 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP153P49790 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP153P49790 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP153P49790 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP153P49790 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP153P49790 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP153P49790 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP153P49790 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP153P49790 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP153P49790 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP153P49790 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP153P49790 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP153P49790 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP153P49790 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP153P49790 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP153P49790 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP153P49790 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP153P49790 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP153P49790 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP153P49790 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP153P49790 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP153P49790 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP153P49790 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP153P49790 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP153P49790 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP153P49790 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP153P49790 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP153P49790 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP153P49790 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP153P49790 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP153P49790 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP153P49790 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP153P49790 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP153P49790 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP153P49790 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP153P49790 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP153P49790 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP153P49790 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP153P49790 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP153P49790 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP153P49790 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP153P49790 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP153P49790 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP153P49790 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP153P49790 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP153P49790 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NUP153P49790 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP153P49790 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP153P49790 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP153P49790 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP153P49790 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP153P49790 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP153P49790 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP153P49790 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP153P49790 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP153P49790 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP153P49790 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP153P49790 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP153P49790 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP153P49790 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP153P49790 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP153P49790 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP153P49790 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP153P49790 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms