Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA3O96018 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA3O96018 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA3O96018 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA3O96018 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA3O96018 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA3O96018 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA3O96018 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA3O96018 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA3O96018 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA3O96018 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA3O96018 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA3O96018 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA3O96018 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA3O96018 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA3O96018 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APBA3O96018 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APBA3O96018 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APBA3O96018 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA3O96018 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA3O96018 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms