Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX4O95219 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX4O95219 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX4O95219 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms