Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms