Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms