Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms