Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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