Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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