Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
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