Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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RTL8BQ17RB0 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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RTL8BQ17RB0 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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RTL8BQ17RB0 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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RTL8BQ17RB0 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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RTL8BQ17RB0 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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RTL8BQ17RB0 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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RTL8BQ17RB0 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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