Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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