Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.59□□□□□ -2
LAMA4Q16363 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
LAMA4Q16363 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA4Q16363 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA4Q16363 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA4Q16363 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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