Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SNCBQ16143 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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