Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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