Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms