Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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COL19A1Q14993 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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COL19A1Q14993 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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COL19A1Q14993 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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