Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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