Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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PDE6HQ13956 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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PDE6HQ13956 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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PDE6HQ13956 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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PDE6HQ13956 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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PDE6HQ13956 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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PDE6HQ13956 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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