| RUNX2 | Q13950 | RNU2-15P-201 | ENST00000410692 | 191 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LIMS1-AS1-201 | ENST00000411710 | 477 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006366.1-201 | ENST00000422002 | 759 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL157378.1-201 | ENST00000424506 | 265 nt | TSL 5 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BBS9-205 | ENST00000425508 | 1252 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC107081.2-201 | ENST00000425779 | 802 nt | TSL 5 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590378.1-201 | ENST00000426818 | 303 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL445259.1-202 | ENST00000434768 | 379 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC096638.2-201 | ENST00000434965 | 711 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND1P28-201 | ENST00000435623 | 950 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023669.2-201 | ENST00000436266 | 239 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091862.1-201 | ENST00000438016 | 1100 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SDCBPP1-201 | ENST00000440192 | 890 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CDC27P1-201 | ENST00000445384 | 715 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC112715.1-201 | ENST00000445534 | 350 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC034228.3-201 | ENST00000446275 | 562 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO2P7-201 | ENST00000446518 | 666 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PAXBP1P1-201 | ENST00000449315 | 447 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL391427.1-201 | ENST00000451575 | 425 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC112229.2-201 | ENST00000456683 | 476 nt | TSL 5 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FPGT-203 | ENST00000467578 | 601 nt | TSL 2 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL585P-201 | ENST00000470538 | 280 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP2-201 | ENST00000471227 | 466 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000797.1-201 | ENST00000478870 | 387 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAM172BP-201 | ENST00000487497 | 1089 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023424.2-201 | ENST00000493479 | 777 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRR16-204 | ENST00000505123 | 1298 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093297.2-207 | ENST00000505401 | 692 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CSN1S1-202 | ENST00000505782 | 871 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093752.2-201 | ENST00000506942 | 573 nt | TSL 5 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CSN1S1-204 | ENST00000507772 | 895 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006499.6-201 | ENST00000511169 | 607 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003472.1-201 | ENST00000519844 | 644 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC026991.1-201 | ENST00000520815 | 463 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008415.1-201 | ENST00000522189 | 734 nt | TSL 5 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090092.1-201 | ENST00000530576 | 510 nt | TSL 2 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FBXO3-210 | ENST00000532057 | 918 nt | TSL 2 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR100HG-221 | ENST00000534297 | 572 nt | TSL 4 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02468-201 | ENST00000543778 | 633 nt | TSL 5 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090049.1-201 | ENST00000551075 | 1011 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AF123462.1-201 | ENST00000554307 | 446 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL355097.1-201 | ENST00000555889 | 539 nt | TSL 4 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC076968.1-201 | ENST00000566418 | 429 nt | TSL 5 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP87-202 | ENST00000573039 | 466 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC097467.3-204 | ENST00000595229 | 827 nt | TSL 5 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590235.2-201 | ENST00000602641 | 632 nt | TSL 5 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FBXW7-AS1-201 | ENST00000605147 | 372 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL365503.1-201 | ENST00000605247 | 905 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN2P28-201 | ENST00000606102 | 262 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CT45A6-201 | ENST00000612878 | 770 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BPY2B-204 | ENST00000615850 | 321 nt | APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR7151-201 | ENST00000617477 | 60 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC138393.3-201 | ENST00000618397 | 573 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BPY2C-204 | ENST00000618574 | 321 nt | APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NFAT5-203 | ENST00000393742 | 13067 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RAD21-210 | ENST00000523986 | 2506 nt | TSL 2 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR11H5P-202 | ENST00000641612 | 1325 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CLCA2-201 | ENST00000370565 | 4025 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR2L3-201 | ENST00000359959 | 2792 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND4P4-201 | ENST00000439033 | 1366 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ENOX2-202 | ENST00000370927 | 3788 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | API5-210 | ENST00000534600 | 1760 nt | TSL 5 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCEL-201 | ENST00000349847 | 2386 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FRYL-205 | ENST00000503238 | 11103 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GDAP2-202 | ENST00000369443 | 8828 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CLEC7A-202 | ENST00000304084 | 1130 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TEX43-201 | ENST00000357147 | 464 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-28P-201 | ENST00000362378 | 107 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP44-201 | ENST00000363602 | 316 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.234-201 | ENST00000364409 | 97 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA70.2-201 | ENST00000364506 | 135 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD116-4-201 | ENST00000384733 | 96 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS7P13-201 | ENST00000413955 | 498 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092832.1-201 | ENST00000422934 | 400 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01934-202 | ENST00000424170 | 686 nt | TSL 4 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLC44A3-AS1-205 | ENST00000424505 | 612 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL391336.1-201 | ENST00000424678 | 484 nt | TSL 3 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL358472.1-201 | ENST00000431295 | 329 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC017048.2-201 | ENST00000431455 | 822 nt | TSL 3 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC109583.1-201 | ENST00000432156 | 268 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL37P21-201 | ENST00000435890 | 276 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL162384.1-201 | ENST00000437881 | 499 nt | TSL 2 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00366-201 | ENST00000441430 | 435 nt | TSL 2 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NUTM2A-AS1-209 | ENST00000447424 | 571 nt | TSL 3 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353691.1-201 | ENST00000451332 | 387 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RAD23BP3-201 | ENST00000454157 | 1152 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01210-201 | ENST00000465283 | 625 nt | TSL 2 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7P19-201 | ENST00000469948 | 618 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104563.1-201 | ENST00000476147 | 376 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FSBP-201 | ENST00000481490 | 1158 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL604P-201 | ENST00000492589 | 296 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ACTR3BP4-201 | ENST00000503033 | 1244 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02014-201 | ENST00000514010 | 713 nt | TSL 3 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC084116.2-201 | ENST00000520171 | 415 nt | TSL 4 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRRTM2-203 | ENST00000521094 | 1182 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAL2-203 | ENST00000534619 | 578 nt | TSL 4 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC046130.2-201 | ENST00000537655 | 794 nt | TSL 3 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02459-201 | ENST00000551761 | 474 nt | TSL 3 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL160314.2-204 | ENST00000554730 | 380 nt | TSL 5 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092326.1-201 | ENST00000567465 | 674 nt | TSL 3 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |