Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
APOFQ13790 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
APOFQ13790 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
APOFQ13790 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
APOFQ13790 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2.59□□□□□ -2
APOFQ13790 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC2.59□□□□□ -2
APOFQ13790 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.59□□□□□ -2
APOFQ13790 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
APOFQ13790 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.58□□□□□ -2
APOFQ13790 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC2.57□□□□□ -2
APOFQ13790 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms