Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TUBA3CQ13748 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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