Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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CUL4AQ13619 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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CUL4AQ13619 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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