Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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TCOF1Q13428 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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TCOF1Q13428 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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TCOF1Q13428 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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TCOF1Q13428 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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