Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
XRCC4Q13426 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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