Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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