Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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CALCOCO2Q13137 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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