Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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NR1H3Q13133 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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NR1H3Q13133 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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NR1H3Q13133 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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NR1H3Q13133 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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NR1H3Q13133 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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NR1H3Q13133 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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NR1H3Q13133 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NR1H3Q13133 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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