Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP4Q13107 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
USP4Q13107 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP4Q13107 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP4Q13107 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP4Q13107 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP4Q13107 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP4Q13107 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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USP4Q13107 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP4Q13107 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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