Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF1Q13077 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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TRAF1Q13077 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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TRAF1Q13077 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
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TRAF1Q13077 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
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