Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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