Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms