Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPN12Q05209 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms